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Prothod 常用功能速查

模块列表

模块名 功能 选项
qm 量子化学计算 选项速查计算参数速查
pepsearch 多肽结构搜索 选项速查

命令

prothod 子命令 [子命令参数]
这些是 prothod 子命令1

子命令 功能
ls 列出提供的功能模块的名称和说明
init 接模块名,为选定的模块创建默认初始输入配置文件
fastboot 接模块名,为所选模块的快速交互式生成初始输入配置文件(部分模块支持)
gen 校验输入文件并生成 Recipe 流程文件但不提交
sub 提交以执行实际计算
run 直接运行“option.txt”中的“run”命令。(对于特殊模块)

独立命令

命令 功能
get_result 将当前文件夹的内容提取到上级 result 文件夹中
clean_progress 在计算过程文件夹内清除上级文件夹的中间过程文件
clean_progress 在项目文件夹内清除同级的中间过程文件

  1. 分别是 list, initialize, generate, submit 等单词的缩写